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| 組織職掌 |
| 醫務管理處 聯絡電話：02-23812010 (代表號) |
- 國軍軍醫軍官、士官經歷管理政策之研究、執行、督導及員額補充作業事項。
- 本局及所屬機構人員人事業務之督導與執行事項。
- 綜辦國防部各種會議裁指示回報與管制業務事項。
- 本局及所屬機構文書、檔案、史政、準則與法規修編作業之督導及管制事項。
- 本局及所屬機構一般進修教育之審議及督導事項。
- 綜理本局及所屬機構營產、設施工程等後勤業務之管制、督導及執行事項。
- 本局及所屬機構政戰法令宣導與政戰業務之策劃、督導及執行事項。
- 一般軍風紀、貪瀆（風氣）案件、輿（檢）情暨官兵違紀犯法、傷亡事件防（查）處及單位個人財產申報作業事項。
- 執行保防（密）教育工作、「正義專案」規定執行及人員安全查核工作事項。
- 綜理本局及所屬機構五年施政工作計畫事項。
| 醫務計畫處 聯絡電話：02-23811593 (代表號) |
- 軍醫政策、制度之規劃及策訂事項。
- 軍醫組織編裝（含組織再造）之規劃、審議及督導事項。
- 國軍醫療機構經營機制與績效管理之規劃、核議及督導事項。
- 本局及所屬機構中、長期發展計畫之核議及督導事項。
- 國軍生產及服務作業基金-醫療作業之規劃、核議及督導事項。
- 國軍醫勤獎助金之規劃及核議事項。
- 國軍衛生統計相關業務之規劃、管理及督導事項。
- 全民健康保險醫療業務之協調、督導及執行事項。
- 本局及所屬機構醫務資訊作業之規劃及督導事項。
- 綜理研考業務事項。
| 醫療保健處 聯絡電話：02-23713187 (代表號) |
- 國軍醫療專業政策之策訂、核議及督考事項。
- 國軍各項體檢及選兵醫學業務策訂、審議及督考事項。
- 軍醫人員專業教育、進修、講習及參訪之規劃、核議及督導事項。
- 國軍航空、潛水醫學及軍陣醫學政策之規劃及督導事項。
- 國軍醫學研究、醫療科技之核議及督導事項。
- 國軍預防保健全般業務之規劃、核議及督導事項。
- 國軍醫療服務、陳情與糾紛之協處及督導事項。
- 國軍醫院醫院評鑑作業之規劃、督導及執行事項。
- 國軍優良醫護人員選拔及表揚之規劃及執行事項。
| 藥政管理處 聯絡電話：02-23712734 (代表號) |
- 國軍平、戰時衛材補給、醫療裝備整備、保修政策之規劃、核議及督導事項。
- 國軍藥品、衛材、醫療裝備及保修之管理與籌補作業策訂及督導事項。
- 國軍藥品、衛材、醫療裝備戰備動員計畫之規劃、核議及督導事項。
- 國軍衛材補給、醫療裝備管理、保修作業各項手冊修編及印頒事項。
- 國軍年度藥品、衛材、保修施政計畫之編訂、執行及督導事項。
- 國軍醫療被服籌補之購案審議及作業督導事項。
- 國軍衛材補給、醫療裝備管理資訊化之系統管理與維護作業之規劃及督導事項。
- 國軍藥事作業之規劃及督導事項。
- 軍醫裝備汰除與廢舊不適用物資處理作業之督導事項。
| 衛勤整備處 聯絡電話：02-23119723 (代表號) |
- 國軍衛生勤務政策之規劃及督導事項。
- 國軍衛生勤務支援與衛生教育計畫策訂及督導事項。
- 國軍衛生部隊指揮、運用事項之建議及督導事項。
- 國軍衛生勤務戰備整備作業之督導事項。
- 國軍傷患調節業務及國軍災害防救、大量傷患演練之協調及督導事項。
- 國軍衛生動員之規劃及督導事項。
- 本局所屬機構動員計畫之核議及督導事項。
- 國軍衛生勤務準則編修審查、督導及考核事項。
- 國軍績優基層衛生單位選拔事項。
| 主計室 聯絡電話：02-23710943 (代表號) |
- 本局及所屬機構主計人員任職管制事項。
- 年度施政計畫與預算編審暨分配管制執行事項。
- 國軍生產及服務作業基金─醫療事業會計事務處理及作業規定研修訂頒事項。
- 附屬單位概（預）、決算、估計、績效及會計月報表編審事項。
- 現金會計帳務處理及代收款計畫之審議事項。
- 對所屬機構主計業務督導及內部審核案件之處理事項。
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