軍隊無遠弗屆，舉凡改進部隊環境衛生到戰場檢傷分類、傷患救治與野戰衛生勤務之運作，均有賴隨隊接受專業訓練之軍醫人員與軍醫單位密切合作，才能達到扶傷救治及提振軍心士氣之目的。故軍醫體制之良窳，對維持部隊戰力有決定性之影響，大部份的國家對軍醫之設置均甚為重視，且不可或缺。

國軍醫院平時除負責維護官兵健康、配合作戰演訓及參與衛勤支援任務外，尚需肩負以下特殊任務：

• 負責兵役、新兵入營、軍校聯招及特殊體檢。
• 負責航空生理訓練及空勤體檢工作。
• 負責潛水醫學之訓練研究與治療。
• 配合動員作業、徵用、徵購醫療設施與衛材。
• 負責戰時所需床位之調節與管制。
• 配合建軍備戰需要研訂軍陣醫學研究發展計畫。
• 負責兵役複檢及傷病官兵殘等檢定作業。
• 配合政府政策，支援友邦國家醫療團作業。

上項業務為目前全民健保特約醫療院所無法取代者，若勉強轉移至民間醫療單位執行，將涉及相關法令之修訂與民間醫院之配合意願，而影響任務之遂行。